陳尚志，2018，「新興小黨的經營困境：以社會民主黨為例」，收錄於《當代弱勢議題》，頁81-110。

陳尚志，2014，「官僚的政治控制：民進黨執政下的政務－事務關係」，收錄於王金壽等合著，《民進黨執政下的政治發展》，頁55-92。麗文文化出版。

陳尚志，2014，「政治時機與政黨菁英偏好變遷：解釋2004年台灣選制變革」，收錄於王金壽等合著，《民進黨執政下的政治發展》，頁239-277。麗文文化出版。

陳尚志，2011，「公平選舉與競選活動管制的革新」，收錄於《打造直接民主的新公義體系：法制與政治重大議題研究論文集》，頁156- 176。台灣智庫：十週年紀念專輯第4冊。

研討會論文

陳尚志，2014，「新直轄市的行政區劃調整難題：以臺南市為例」，發表於2014年臺灣政治學會年會暨《當前全球民主實踐的再思考：困境、挑戰與突破》國際學術研討會，台北：台灣大學社科院，2014年12月6-7日。

陳尚志，2014，「2014年高雄市長選舉政見比較分析」，發表於《候選人與選民的政治契約》研討會，財團法人台灣傳統基金會主辦，台北：台灣大學法學院，2014年11月8日。

陳尚志，2013，「失控的「專家治理」？：論「獨立機構」的民主課責」，發表於《2013 TASPAA國際學術研討會》，南投：國立暨南大學，2013年5月25日。

陳尚志，2011，「建構『公費候選人』選舉制度」，台灣智庫《改造國會、終結亂象》研討會，台灣大學法學院國際會議廳，2011年9月25日。

陳尚志，2010，「台灣民主品質的三大問題」，台灣智庫《邁向台灣第三波民主改革》研討會，2010年3月21日。

陳尚志，2009，「台灣政黨輪替與中國對台政策：馬英九執政時期兩岸政府之間的互動」，發表於《台灣政治學會2009年年會暨學術研討會》，新竹：玄奘大學，2009年11月21-22日。

Shang-chih Chen. 2009. "Hu Jintao's New Taiwan Policy: An Analysis of the Event Data of the Beijing-Taipei Interactions." Paper will be presented at the 50th Annual Convention for the International Studies Association, New York City, NY, February 15-18, 2009.

陳尚志，2008a，「偏好結構改變與2004年台灣的選舉制度變革」，發表於台灣政治學會2008年年會暨學術研討會，南投：國立暨南國際大學，2008年11月22-23日。

Shang-chih Chen. 2008b. "The Study of Beijing's Taiwan Policy Making: Insights and Pitfalls." Paper presented at the 50th Annual Conference of the American Association for Chinese Studies, California State University at Fullerton, CA, October 17-19, 2008.

陳尚志，2007，「政黨輪替與官僚的政治控制：民進黨中央政務幕僚執政經驗分析」，發表於台灣政治學會2007年年會暨學術研討會，台北：國立政治大學，2007年11月17-18日。

Shang-chih Chen. 2006. “A Threat or Misguided Goodwill? Beijing’s Enactment of the Anti-Secession Law.” Paper presented at the 102nd Annual Meeting of the American Political Science Association, Philadelphia, August 31- September 3, 2006.

Shang-chih Chen. 2005. “Between Negotiation and Confrontation: Explaining China’s Taiwan Policy Redirections after the Cold War.” Paper presented at the 2005 Annual Meeting of the Association for Asian Studies, Chicago, April 1-3, 2005.

Shang-chih Chen. 2004a. “Changing Leadership Perceptions: How China Perceives External Situations and Redirects Its Taiwan Policy.” Paper presented at the 2004 Annual Meeting of the Taiwanese Political Science Association, I-Shou University, Taiwan, December 18-19, 2004.

Shang-chih Chen. 2004b. “Chinese Perceptions of Sino-US Relations and Beijing’s Taiwan Policy Changes, 1989-2000.” Paper presented at the 46th Annual Conference of the American Association for Chinese Studies, College of William & Mary, Williamsburg, Virginia, October 22-24, 2004.

Shang-chih Chen. 2004c. “A Shadow over Democracy? Reflections on the 2004 Taiwan Presidential Election and Its Aftermath.” Paper presented at the 46th Annual Conference of the American Association for Chinese Studies, College of William & Mary, Williamsburg, Virginia, October22-24, 2004.

陳尚志(共同主持人)，2013，「補助人文及社會科學研究圖書計畫規劃主題：全球化下的民主治理、社會資本與政治信任」，，2013年

陳尚志（主持人），2012，「臺南直轄市行政區劃深度訪談計畫」，台南市政府研考會委託研究計畫，2012年6月至2013年9月。

陳尚志（共同主持人），2010，「台灣政黨的持續與變遷--台灣政黨的持續與變遷：政黨凝聚力」，國科會專題研究計畫。

陳尚志（計畫主持人），2010，「搜尋選制變革的動力：公眾壓力、懦夫賽局與菁英偏好變遷」，國科會專題研究計畫，2010年8月1日至2011年7月31日。（99-2410-H-194-056-）。

陳尚志（主持人），2009，「胡錦濤主政下的北京對台政策：模式與影響變項之資料庫的建置與分析」，國科會專題研究計畫（二年期），2007年9月1日至2009年7月31日。（NSC96-2414-H-194-024-MY2）。

陳尚志，2012，「以『公共課責』取代『評鑑』：思索高教評鑑制度替代方案」，立法院《體檢高等教育評鑑制度》公聽會發言稿。

陳尚志，2012，「誰來評鑑『大學評鑑』？」，《新新聞》，1334期，頁11。

陳尚志，2011，「候選人的人權素養：人權政策問卷結果分析」，《台灣人權促進會季刊：選舉與人權專輯》，2011冬季號，頁5-8。

陳尚志，2011，「公平選舉改革的開端：『公費候選人』制」，《台灣思想坦克雙月刊》，第14期，頁61-65。

陳尚志，2010，「馬政府的期中民主診斷」，《財訊雙週刊》，第347期，頁72-73。

陳尚志，2009，「鄉土認同與國家認同有何不同？」，《新使者》，第114期，頁28-31。

陳尚志，2008，「民進黨對不起台灣人」，《新新聞》，1098A期，頁61-63。